一個功能完善的微生物實驗室通常包括以下邏輯分區(qū)，它們在物理或氣流上應有分隔：
| 分區(qū) | 核心功能 | 生物安全與潔凈度要求 | 關鍵設施與設備 |
|---|---|---|---|
| 1. 清潔區(qū) | 辦公室、會議室、休息室、培養(yǎng)基/試劑倉庫。 | 普通環(huán)境，無特殊凈化要求。 | 辦公設施、倉儲柜。 |
| 2. 緩沖區(qū)（準清潔區(qū)） | 更衣室、淋浴間（BSL-2常設）、實驗準備區(qū)（培養(yǎng)基配制、器皿清洗消毒后存放）。 | 正壓。環(huán)境清潔，接近十萬級（ISO 8），防止外部污染物進入核心區(qū)。 | 更衣柜、化學品安全柜、洗眼器、培養(yǎng)基制備用超凈工作臺。 |
| 3. 核心實驗/污染區(qū) | 樣品處理、接種、培養(yǎng)、鑒定、藥敏試驗等所有涉及活菌操作的區(qū)域。 | 負壓或常壓（具體看設計）。需根據(jù)操作劃分不同級別的子區(qū)。 | 生物安全柜（核心設備）、培養(yǎng)箱、冰箱、顯微鏡、自動化鑒定儀。 |
| 4. 高壓滅菌與污物處理區(qū) | 實驗廢棄物（含菌平板、試管、利器）的就地滅活、暫存。 | 常壓或微負壓，獨立通風。必須與清潔區(qū)嚴格分開。 | 雙扉高壓滅菌器（一面對著污染區(qū)，一面對著清潔區(qū)外）、污物暫存容器。 |
